实验室简介

        南方科技大学海洋地球古菌组学重点实验室的发展愿景和使命是:在满足国家战略需求的基础上,拥有最雄厚的师资队伍,通过系统研究的创新和优秀复合型人才的培养,成为国际顶尖生物地球化学实验平台之一。本研究团队以地球三大生命形式之一的“古菌”作为南方科技大学海洋学科重点研究方向,紧紧围绕“古菌在海洋和生物地质演化的相互作用”这一科学问题,组织和凝聚了一个强有力的研究团队。团队成员在海洋生物学、海洋地质学、海洋沉积动力学、化学生物、分子生物学、结构生物学、生物工程、海洋技术等各个方面已有很好的工作积累,取得了一系列原创性成果,已建立了分子、脂质、化学、环境多层次研究体系和实验模型,为本团队的研究项目的开展和完成垫定了扎实的基础。且本研究团队成员在Science、PNAS、Geology、Frontiers in Microbiology、ISMEJ、Environmental Microbiology、Marine Geology 、Geophysical Research Letters等重要学术期刊上共发表多篇通讯作者/第一作者研究论文。

        实验室主任及学术带头人张传伦是现任南方科技大学海洋科学与工程系副主任、讲座教授,目前担任“古菌”和“中国科学:地球科学”期刊编委,及欧洲“微生物前沿”期刊副主编。实验室成员都是南方科技大学的教授和工程技术研究人员,有着丰富的专业知识和多年的海上工作经验,研究硕果累累。海洋地球古菌组学重点实验室的成立,将发挥海洋多学科交叉优势,聚集南科大海洋、环境、生物和化学等众院系的科研力量,在海洋科学与生命科学交叉研究领域开展国际前瞻性研究。

        本实验室已经配备了一台数学计算HPC-Cluster,初步建立了生物信息学分析平台。且已购置了荧光/紫外光谱仪、荧光定量PCR仪、超速离心机、三维荧光光谱仪、液相色谱-质谱联用仪和气相色谱-质谱联用仪、偏光显微镜、超微量紫外分光光度计等大型仪器,正在招标和联系购置流式细胞分析仪、营养盐连续流动化学分析和傅立叶红外光谱仪等大型仪器,还计划购置电感耦合等离子体质谱仪和总有机碳/总氮分析仪等大型仪器等大型仪器。且目前有较好的科研实验平台,科研用房面积828多平方米,已有仪器设备及专用软件的现值740多万,2018年已确定购置的大型仪器设备300万。南科大也正在建设理工科大楼和目前的四大分析测试中心,完全可以满足重点实验室全方位的科研需求。这些支撑条件对于本项目的按期实施与顺利完成,将起到有力的保障作用。目前,实验室已建立细菌、古菌富集和培养,FISH,PCR,qPCR,高通量测序、宏基因组、单细胞基因组和生物信息学分析、同位素分析、脂质分析等多种常用及国际领先的实验技术。通过前期派遣科研、技术人员的国际交流学习,极大的保证了样品前处理,及仪器分析结果的准确性。实验室学术团队多数成员在回国前都有主持和承担项目课题的经历且实验室主任张传伦教授2017年入职南科大,享有南科大科研启动学校配套经费1000万和深圳市人才启动费用500万,实验室副主任和核心骨干人员均享有南科大和深圳市科研启动经费。综上所述,实验室研究团队有很好的科研条件和工作环境以及项目研究所需的各种硬件和软件条件。

功能布局及大型设备

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综合生物实验室

可开展分子生物学、生物化学、环境微生物学、微生物细胞培养等实验操作。其中的超净实验室装备有生物安全柜,满足生物样本超净培养需求。

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有机地球化学实验室

可开展海洋水体、沉积物等环境样品中有机质的组成分析。包括同位素标记、脂类提取等操作。含有吸收三维荧光扫描光谱仪、旋转蒸发仪、固相萃取仪、冷冻干燥机、马沸炉等仪器。

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精密仪器室

包含高分辨离子淌度四极杆串联飞行时间质谱联用仪 (Ion mobility quadrupole time of flight mass spectrometer)、气相色谱-质谱联用仪(GC-MS)、液相色谱—质谱联用仪(LC-MS)、流式细胞仪、荧光显微镜等大型设备。

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高性能计算分析平台

实验室目前拥有一台高性能服务器,目前可进行五核最多160 个CPU集群并行运算。服务器上已建立了完整的微生物高通量数据和微生物基因组分析流程。

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海洋环境样本采集平台

多种常用海水水体和沉积物采集装置与设备,可满足从近海到远洋的各类海洋物理化学参数测量和微生物样本采集。

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